首先，我們需要明確的是，在原作漫畫或動畫中，并沒有明確描述卡卡西親手殺害琳的情節。相反，琳的死是由赤砂之蝎的父親——千代婆婆所造成的悲劇性事件。當時，琳作為曉組織的一員，被蝎誤認為是敵人而遭到攻擊。這場誤會導致了琳的死亡，而卡卡西當時并不在現場，更沒有參與這一事件。
然而，從另一個角度來看，卡卡西確實間接地影響了琳的命運。在第四次忍界大戰期間，卡卡西作為忍聯軍的重要指揮官之一，與眾多忍者并肩作戰。而琳則以藥師兜的身份回歸戰場，并成為了敵對陣營的一員。這種身份上的對立，使得兩人之間的關系變得復雜且充滿矛盾。
更為重要的是，卡卡西與琳之間存在著深厚的感情紐帶。他們曾經同屬第七班，是親密無間的隊友。特別是卡卡西與琳之間的感情超越了普通的師徒關系，但最終卻因為戰爭和各自的選擇而走向分離。當琳以敵人的姿態出現時，卡卡西內心充滿了痛苦與掙扎，這也反映了他對于這段過往記憶的深刻懷念以及對琳逝去生命的深切哀悼。
綜上所述，“旗木卡卡西為什么要殺了琳”這一問題的答案其實并不在于卡卡西本人是否真的實施了殺戮行為，而更多地體現了作品對于戰爭背景下人性復雜性的探討。通過這些情節安排，《火影忍者》不僅塑造了更加立體的人物形象，也讓觀眾感受到友情、愛情以及犧牲等主題所帶來的震撼力量。
